Н.С. Бабекина окончила Московский технический университет связи и информатики по специальности «Радиосвязь, радиовещание и телевидение»;специальность «защита информации»; Дипломатическую академию Министерства иностранных дел Российской Федерации по специальности «Мировая экономика».

Поступила на государственную гражданскую службу в Департамент международного сотрудничества Мининформсвязи России в августе 2004 г. на должность специалиста первой категории отдела двустороннего сотрудничества с зарубежными странами. В сферу ее деятельности входила работа со странами Азиатско-Тихоокеанского региона, США, Комиссией Евросоюза, со странами Латинской Америки. Далее работала ведущим, главным специалистом, заместителем начальника отдела. Вела работу с СНГ, Региональным содружеством в области связи, ШОС, Советом государств Балтийского моря, по проекту «Северное измерение». В марте 2007 года Бабекина Н.С. была назначена начальником отдела международных организаций.

С 8 апреля 2020 года - заместитель директора Департамента международного сотрудничества: регулировала сотрудничество с международными организациями, являлась ответственным координатором таких тем, как: «укрепление доверия и безопасности при использовании ИКТ», «международная информационная безопасность», «управление использованием Интернет»; отвечала за формирование кадрового резерва Министерства; занималась формированием позиции АС России в международных организациях, разработкой стратегии и тактики ее защиты.

Регулярно руководила делегациями на международных мероприятиях; проводила двусторонние и многосторонние консультации в форматах ООН, МСЭ, БРИКС, ШОС и РСС; выполняла функции ответственного спикера, председателя и вице-председателя рабочих групп и комитетов.

С 29 июня 2021 года - заместитель директора Департамента развития отрасли информационных технологий. В сферу обязанностей входит координация развития и поддержки экспорта продукции и услуг, производимых российскими компаниями отрасли ИКТ.

В процессе своей научной и преподавательской деятельности Н.С. Бабекиной был разработан курс «Национальные интересы и международное сотрудничество в развитии ИКТ инфраструктуры» для вузовской программы «Информационная безопасность»; в настоящее время преподает магистерскую программу по данной дисциплине в Московском Техническом Университете Связи и Информатики.

Является членом Редакционной коллегии ежемесячного отраслевого научно-технического журнала «Вестник связи».

Публикации: аналитический информационный журнал «Документальная электросвязь»: «Аспекты международного регулирования электросвязи и информационно-коммуникационных технологий (ИКТ)» 2020 г., «Культура и этика в цифровой среде» 2020 г.; ежемесячный научно-политический журнал «Международная жизнь» (включен в Перечень рецензируемых научных изданий ВАК по основным специальностям) «Перспективы развития института белых хакеров» 2021 г., «Международное сотрудничество в области защиты персональных данных: деятельность в рамках Совета Европы», 2021 г., «Форум Всемирной встречи на высшем уровне по вопросам информационного общества: председательство Российской Федерации» 2021 г., журнал «Вестник связи»: «Современные меры поддержки ИТ-отрасли в России», 2021 г.; аналитический информационный журнал «Документальная электросвязь»: «Принцип глокализации, как залог справедливого международного взаимодействия», 2021 г., ежемесячный научно-политический журнал «Международная жизнь»: «Технологический суверенитет – как современный гарант киберстабильности», 2023 г.

Н.С. Бабекина имеет благодарности Министра связи и массовых коммуникаций Российской Федерации, благодарность Генерального секретаря Международного союза электросвязи Х. Чжао за высокий профессионализм в работе; отмечена Почетной грамотой Регионального содружества в области связи, благодарностью ФГБУ «Связист», благодарностями Ассоциации документальной электросвязи.

29 сентября 2021 г. награждена медалью им. А.С. Попова за вклад в развитие отрасли связь. 24 октября 2021 г. награждена медалью Министерства иностранных дел Российской Федерации «За вклад в обеспечение международной информационной безопасности».